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常见问题
Q
GDRC的突变基因是如何选择的?
A
关于我们选择突变的基因,项目初始阶段,我们选择潜在的与果蝇天然免疫相关的基因进行敲除。随后,选择重要的信号通路、基因家族,逐渐扩展到全基因组范围。在选择这些敲除的目的基因时,我们优选选择目前还没有突变体报道的基因进行敲除。
Q
GDRC的基因突变体是如何制作的?
A
我们利用CRISPR/Cas9系统制作果蝇基因突变体,大致分为三个主要步骤:设计构建gRNA表达质粒,遗传杂交产生突变,鉴定突变并建立品系。具体而言,1)通过软件为每个待敲除基因选择一个Cas9靶序列,构建至U6启动子的表达质粒;2)显微注射,获得gRNA转基因果蝇品系。将gRNA转基因果蝇与nos-Cas9工具果蝇品系杂交,后代中产生目的基因突变体;3)通过PCR并测序,选择在目的基因编码区产生移码的突变体建立稳定品系并保种。
Q
GDRC的基因突变体是什么基因型?
A
1号染色体基因的基因型为:M/FM7c, w+; ;+/w+(or y+)。2号染色体基因的基因型为 :M/CyO (or BcG); +/w+(or y+)。3号染色体基因的基因型为: ;+/w+(or y+); M/TM6B,Tb (or TM3,Sb)(M代表相应基因的mutation)。“w+(or y+)”表示该果蝇品系要么带有w+,要么带有y+,不可能同时带有二者。具体使用过程,建议去除w+和 y+。本中心也在持续进行这些marker所代表的元件的去除工作。
Q
GDRC的基因突变体用什么果蝇品系作对照?
A
初步表型分析建议使用野生型果蝇如w1118、 yw等。基因功能的精确分析,建议先将突变体进行回交再进行实验。
Q
每个基因有几个突变体?
A
我们每个基因有1-3个不同的突变体(不同的allele)。
Q
基因的突变发生在什么位置?
A
我们的突变体的基因突变(indel)位于编码序列上,通常发生在目标基因编码序列前1/3,尽量靠近ATG的地方。具体请参考突变体“品系信息”中“Mutation”提供的序列信息。
Q
中国大陆境外的研究机构是否可以订购GDRC的果蝇品系?
A
对国内、国际的科研机构共享果蝇品系是我们的目标。目前,受相关条件限制,我们暂时只对中国大陆境内的科研机构开放共享果蝇品系。我们正在努力解决问题,尽快实现国际共享。
Q
我从GDRC共享获得的果蝇品系,是否可以随意分享给其他人?
A
根据注册账户时签署的MTA文件,这是不被允许的。用户(PI)通过共享,获得相应果蝇品系的使用权,但无权未经允许将该品系私自提供给第三方。对于未经共享申请而私自接受他人从本中心获得的果蝇品系者,这是侵权行为。为了中国果蝇科研圈的健康发展,请大家保护知识产权。
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